Sở Khoa học và Công nghệ tỉnh ĐắkLắk được thành lập vào ngày 6/6/1978 theo quyết định số 327 QĐ-UB của UBND tỉnh với tên gọi là Ban khoa học kỹ thuật và do ông Trần Lý làm Trưởng ban. Bước đầu, Ban khoa học kỹ thuật có nhiệm vụ:
- Tham mưu cho Ủy ban nhân dân tỉnh về: Phương hướng nhiệm vụ về công tác khoa học kỹ thuật lâu dài và trước mắt; Chỉ đạo việc nghiên cứu ứng dụng tiến bộ khoa học kỹ thuật phục vụ sản xuất nông, lâm, công nghiệp và đời sống; Nghiên cứu chính sách chế độ đào tạo sử dụng hợp lý cán bộ khoa học kỹ thuật.
- Chỉ đạo việc kế hoạch hoá công tác nghiên cứu ứng dụng khoa học kỹ thuật của các huyện thị, Ty, ban ngành trong tỉnh.
- Chỉ đạo, tổ chức xây dựng nề nếp quản lý khoa học kỹ thuật trong địa phương trên 3 mặt: Tiêu chuẩn hoá, Kiểm tra chất lượng sản phẩm, Kiểm định đo lường.
- Tham mưu chỉ đạo phương trào phát huy sáng kiến, cải tiến kỹ thuật, cải tiến quản lý các huyện, thị, Ty ban ngành trong tỉnh.
- Tổ chức việc thông tin khoa học phục vụ kịp thời cho công tác lãnh đạo, chỉ đạo sản xuất và xây dựng của tỉnh.
- Tổ chức việc quan hệ với các cơ quan nghiên cứu khoa học kỹ thuật của Trung ương và các tỉnh bạn để phục vụ những vấn đề trọng điểm trong kế hoạch sản xuất và xây dựng của tỉnh và của trung ương tại địa phương.
- Nghiên cứu chỉ đạo việc xây dựng mạng lưới thực nghiệm tiến bộ khoa học kỹ thuật tới các ngành và cơ sở sản xuất quốc doanh và tập thể.
- Trực tiếp làm một số công trình nghiên cứu ứng dụng được phân công.
- Chuẩn bị cơ sở vật chất để tiến tới thành lập uỷ ban khoa học chuyên trách của tỉnh.
Năm 1983, căn cứ Nghị định số 24/CP, ngày 2/2/1976 của Hội đồng Chính phủ và Nghị quyết số 51 ngày 17 - 5 - 1983 của Hội đồng Bộ trưởng về quy định nhiệm vụ, quyền hạn và trách nhiệm của chính quyền nhà nước cấp tỉnh, một số vấn đề công tác khoa học và kỹ thuật năm 1983 và những năm tiếp theo, UBND tỉnh đã quyết định đổi tên Ban khoa học kỹ thuật thành Ủy ban Khoa học và kỹ thuật (Quyết định số 48 QĐ-UB, ngày 8/8/1983)
Năm 1988, thực hiện thông báo số 46-TB/TW ngày 12-12-1987 của Ban Bí thư TW Đảng về tổ chức bộ máy các tỉnh, thành phố, quận, huyện và cấp tương đương và Quyết định số 227-HĐBT ngày 29-12-1987 của Hội đồng Bộ trưởng về việc sắp xếp lại tổ chức tinh giản biên chế các cơ quan hành chính - sự nghiệp, UBND tỉnh đã sửa đổi tên Uỷ ban khoa học và kỹ thuật thành Ban khoa học và kỹ thuật.
Đến năm 1993, căn cứ vào Thông tư Liên bộ số 1450/LB-TT của Bộ Khoa học Công nghệ và Môi trường - Ban tổ chức cán bộ Chính phủ hướng dẫn chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và tổ chức cơ quan quản lý khoa học, công nghệ và môi trường các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương, UBND tỉnh đã quyết định chuyển đổi Ban khoa học và kỹ thuật thành Sở Khoa học Công nghệ và Môi trường gồm có phòng quản lý khoa học - công nghệ, phòng quản lý môi trường, phòng tổ chức - hành chính - tài vụ và 3 đơn vị trực thuộc là Chi cục Tiêu chuẩn - Đo lường - Chất lượng, Trung tâm Ứng dụng khoa học và công nghệ, Trạm thực nghiệm sinh học.
Năm 2003, thực hiện quyết định của Thủ tướng Chính phủ về việc thành lập Sở Tài nguyên Môi trường nên Sở Khoa học Công nghệ và Môi trường được đổi tên thành Sở Khoa học và Công nghệ theo Quyết định số 73/2003/QĐ-UB, ngày 27/5/2003 của UBND tỉnh ĐắkLắk.